Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms