Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms