Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD4Q9ULV1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms