Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND2AQ9ULE3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms