Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms