Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMFRQ9UKV5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms