Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms