Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms