Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms