Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP25Q9UHP3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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