Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDP1Q9P0J1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms