Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN3Q9NZ94 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms