Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf109Q9NX04 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms