Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BSDC1Q9NW68 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms