Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBM28Q9NW13 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM28Q9NW13 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM28Q9NW13 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM28Q9NW13 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM28Q9NW13 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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