Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMBRD1Q9NUN5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms