Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms