Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.6 ms