Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms