Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms