Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms