Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEBOXQ9HB31 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms