Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms