Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF2Q9HAU5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms