Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAF1Q9H7N4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF1Q9H7N4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms