Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms