Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms