Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MIXL1Q9H2W2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms