Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1EQ9GZS1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms