Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms