Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHACTR1Q9C0D0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms