Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms