Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms