Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRIP1Q9BX63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms