Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS2Q9BVG9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms