Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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