Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms