Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22CQ9BRL7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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