Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF4Q9BRK5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF4Q9BRK5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms