Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms