Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3CQ99985 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms