Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF5Q99942 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF5Q99942 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF5Q99942 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF5Q99942 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms