Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SIN3AQ96ST3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms