Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms