Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms