Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HHIPL1Q96JK4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms