Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED3Q96IU2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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