Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms