Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms