Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms